تعیین فنوتیپ گیاهی با توان بالا - روشها و پروتکل ها High-Throughput Plant Phenotyping_ Methods and Protocols

فهرست مطالب: Preface........ . . . . . v Contributors......... ix PART I HTP PROTOCOLS FOR PLANTS GROWING UNDER CONTROLLED CONDITIONS 1 High-Throughput Screening to Examine the Dynamic of Stay-Green by an Imaging System...... . . . 3 2 An Automated High-Throughput Phenotyping System for Marchantia polymorpha...... . . . . . . 11 3 A Novel High-Throughput Phenotyping Hydroponic System for Nitrogen Deficiency Studies in Arabidopsis thaliana.. . . . . . 19 4 Camelina sativa High-Throughput Phenotyping Under Normal and Salt Conditions Using a Plant Phenomics Platform... . . . . . 25 5 A Straightforward High-Throughput Aboveground Phenotyping Platform for Small- to Medium-Sized Plants... . . . . . . . 37 6 Wireless Fixed Camera Network for Greenhouse-Based Plant Phenotyping...... . . . . . . 49 7 Experimental Design for Controlled Environment High-Throughput Plant Phenotyping...... . . . . . . 57 PART II NOVEL ALGORITHMS FOR HTP 8 High-Throughput Extraction of Seed Traits Using Image Acquisition and Analysis...... . 71 9 ColourQuant: A High-Throughput Technique to Extract and Quantify Color Phenotypes from Plant Images... . 77 10 Using Cameras for Precise Measurement of Two-Dimensional Plant Features: CASS....... . . . 87 PART III MOLECULAR PLANT IMAGING 11 Positron Emission Tomography (PET) for Molecular Plant Imaging. . . 97 12 Phenotyping Complex Plant Structures with a Large Format Industrial Scale High-Resolution X-Ray Tomography Instrument. . . . . 119 PART IV HTP PROTOCOLS FOR PLANTS GROWING UNDER FIELD CONDITIONS 13 Challenges for a Massive Implementation of Phenomics in Plant Breeding Programs..... . . . . . . 135 14 Designing Experiments for Physiological Phenomics... 159 15 Design Considerations for In-Field Measurement of Plant Architecture Traits Using Ground-Based Platforms... . 171 16 Design and Construction of Unmanned Ground Vehicles for Sub-canopy Plant Phenotyping..... 191 17 Nighttime Chlorophyll Fluorescence Imaging of Dark-Adapted Plants Using a Robotic Field Phenotyping Platform.... 213 PART V MOLECULAR, METABOLOMICS, NETWORK ANALYSIS, AND QUANTITATIVE GENETIC ANALYSIS OF HTP DATA 18 A Method for Rapid and Reliable Molecular Detection of Drought-Response Genes in Sorghum bicolor (L.) Moench Roots. . . 223 19 High-Throughput Profiling of Metabolic Phenotypes Using High-Resolution GC-MS..... . . 235 20 Gene Co-expression Network Analysis and Linking Modules to Phenotyping Response in Plants..... . . . . . . . 261 21 Statistical Methods for the Quantitative Genetic Analysis of High-Throughput Phenotyping Data.... . . . 269 Index........ . . . . . . 297
فهرست به فارسی (ترجمه ماشینی): پیشگفتار......... . . . . v مشارکت کنندگان......... ix بخش اول پروتکل های HTP برای گیاهانی که تحت شرایط کنترل شده رشد می کنند 1 غربالگری با توان بالا برای بررسی پویایی سبز ماندن توسط یک سیستم تصویربرداری...... . . . 3 2 یک سیستم فنوتیپ خودکار با توان عملیاتی بالا برای Marchantia polymorpha...... . . . . . . 11 3 یک سیستم هیدروپونیک فنوتیپ با توان بالا برای مطالعات کمبود نیتروژن در Arabidopsis thaliana.. . . . . . 19 4 Camelina sativa فنوتیپ با توان عملیاتی بالا در شرایط نرمال و نمک با استفاده از پلت فرم Phenomics گیاهی... . . . . . 25 5 پلتفرم ساده فنوتیپ با توان عملیاتی بالا برای گیاهان کوچک تا متوسط... . . . . . . . 37 6 شبکه دوربین ثابت بی سیم برای فنوتیپ گیاهی مبتنی بر گلخانه...... . . . . . . 49 7 طراحی آزمایشی برای محیط کنترل شده فنوتیپ کارخانه با توان عملیاتی بالا...... . . . . . . 57 بخش دوم الگوریتم های رمان برای HTP 8 استخراج با توان عملیاتی بالا صفات بذر با استفاده از اکتساب و تجزیه و تحلیل تصویر...... . 71 9 ColorQuant: تکنیکی با توان عملیاتی بالا برای استخراج و کمیت کردن فنوتیپ های رنگی از تصاویر گیاهان... . 77 10 استفاده از دوربین ها برای اندازه گیری دقیق گیاهان دوبعدی: CASS....... . . . 87 بخش سوم تصویربرداری از گیاهان مولکولی 11 توموگرافی انتشار پوزیترون (PET) برای تصویربرداری گیاهی مولکولی. . . 97 12 فنوتیپ سازه های پیچیده گیاهی با مقیاس صنعتی با وضوح بالا ابزار توموگرافی اشعه ایکس. . . . . 119 بخش چهارم پروتکل های HTP برای گیاهانی که تحت شرایط مزرعه رشد می کنند 13 چالش برای اجرای گسترده فنومیک در برنامه های اصلاح نباتات..... . . . . . . 135 14 طراحی آزمایش برای فنومیک فیزیولوژیکی ... 159 15 ملاحظات طراحی برای اندازه گیری درون میدانی ویژگی های معماری گیاهی با استفاده از سکوهای زمینی... . 171 16 طراحی و ساخت وسایل نقلیه زمینی بدون سرنشین برای فنوتیپینگ گیاهان زیرسایبانی ..... 191 17 تصویربرداری فلورسانس کلروفیل شبانه از گیاهان سازگار با تاریکی با استفاده از یک بستر فنوتیپ میدان رباتیک .... 213 بخش پنجم مولکولی، متابولومیک، تجزیه و تحلیل شبکه، و تجزیه و تحلیل ژنتیکی کمی داده های HTP 18 روشی برای تشخیص مولکولی سریع و قابل اطمینان ژن‌های پاسخ به خشکی در ریشه‌های Moench دو رنگ سورگوم (L.). . . 223 19 پروفایل با توان عملیاتی بالا فنوتیپ های متابولیک با استفاده از GC-MS با وضوح بالا..... . . 235 20 تجزیه و تحلیل شبکه هم بیان ژن و پیوند ماژول ها به پاسخ فنوتیپ در گیاهان..... . . . . . . . 261 21 روش آماری برای تجزیه و تحلیل ژنتیکی کمی داده های فنوتیپینگ با توان عملیاتی بالا.... . . . 269 فهرست مطالب........ . . . . . . 297
مشخصات فایل
عنوان (Title):	High-Throughput Plant Phenotyping_ Methods and Protocols
نام فایل (File name):	1189-www.GeneProtocols.ir-High-Throughput Plant Phenotyping_ Methods and Protocols (Methods.pdf
عنوان فارسی (Title in Persian):	تعیین فنوتیپ گیاهی با توان بالا - روشها و پروتکل ها
ایجاد کننده:	Argelia Lorence (editor), Karina Medina Jimenez (editor)
زبان (Language):	انگلیسی English
سال انتشار:	2022
شابک ISBN:	ISBN 978-1-0716-2536-1 ISBN 978-1-0716-2537-8
نوع سند (Doc. type):	کتاب
فرمت (File extention):	PDF
حجم فایل (File size):	12 مگابایت
تعداد صفحات (Book length in pages):	300

پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود

درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید