تعیین ژنوتیپ گیاهان - روشها و پروتکل ها Plant Genotyping_ Methods and Protocols

فهرست مطالب: Preface................ . . . . . v Contributors................. xi 1 Genotyping by Sequencing (GBS) for Genome-Wide SNP Identification in Plants............. . . 1 2 Genotyping by Multiplexed Sequencing (GMS) Using SNP Markers.. . . 9 3 Computational Protocol for DNA Methylation Profiling in Plants Using Restriction Enzyme-Based Genome Reduction.....23 4 Double Digest Restriction-Site Associated DNA Sequencing (ddRADseq) Technology............ 37 5 Whole Genome Wide SSR Markers Identification Based on ddRADseq Data............ . . . . . 59 6 High-Throughput Association Mapping in Brassica napus L.: Methods and Applications...........67 7 Polyploid SNP Genotyping Using the MassARRAY System.... . . 93 8 qPCR Genotyping of Polyploid Species......... . . . 115 9 Genome-Wide Association Studies (GWAS)........ 123 10 Transcriptomic Approach for Global Distribution of SNP/Indel and Plant Genotyping............ . . . 147 11 Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq).... . 165 12 Modifications of Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) Genotyping for Detection of Rare Alleles.......... . . . . . 173 13 Amplifluor-Based SNP Genotyping.........191 14 SNP Genotyping with Amplifluor-Like Method...... . . . . 201 15 Semi-Thermal Asymmetric Reverse PCR (STARP) Genotyping... . . . . . . 221 16 Modified Allele-Specific qPCR (ASQ) Genotyping...... . . 231 17 Allele-Specific Mutation Genotyping with Mismatches in Primer Design..............249 18 PCR Allele Competitive Extension (PACE)........ 263 19 Molecular Beacon Probe (MBP)-Based Real-Time PCR.... . . . . . 273 20 Molecular Beacons – Loop-Mediated Amplification (MB-LAMP)... . . . . 289 21 TaqMan Probes for Plant Species Identification and Quantification in Food and Feed Traceability.......... . . . . 301 22 Tetra-Primer Amplification Refractory Mutation System (T-ARMS)... . . 315 23 Penta-Primer Amplification Refractory Mutation System (PARMS) with Direct PCR-Based SNP Marker-Assisted Selection (D-MAS).. . . . . 327 24 High-Resolution Melting (HRM) Genotyping...... . . . . . 337 25 Modified High-Resolution Melting (HRM) Marker Systems Increasing Discriminability Between Homozygous Alleles.... . . . 351 26 A New SNP Genotyping Technology by Target SNP-Seq..... . . . 365 27 Derived Polymorphic Amplified Cleaved Sequence (dPACS) Assay... . . . 373 28 Tubulin-Based Polymorphism (TBP) in Plant Genotyping.... . . . 387 29 Multiplexed ISSR Genotyping by Sequencing (MIG-Seq).... . . . 403 30 Application of SolCAP Genotyping in Potato (Solanum tuberosum L.) Association Mapping............ . . . . 415 31 Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) for the Genotyping of Triticeae Tribe Species and Hybrids......... . . . . 437 32 Innovative Advances in Plant Genotyping......... . 451 Index................ . . . . . . 467
فهرست به فارسی (ترجمه ماشینی): پیشگفتار................. . . . . v مشارکت کنندگان................. xi 1 ژنوتیپ با توالی یابی (GBS) برای شناسایی SNP گسترده ژنوم در گیاهان............. . . 1 2 ژنوتیپ با توالی یابی چندگانه (GMS) با استفاده از نشانگرهای SNP.. . . 9 3 پروتکل محاسباتی برای پروفایل متیلاسیون DNA در گیاهان با استفاده از کاهش ژنوم مبتنی بر آنزیم محدود.....23 4 فناوری توالی DNA مرتبط با محدودیت هضم-محل (ddRADseq)............. 37 5 شناسایی نشانگرهای SSR گسترده ژنوم بر اساس داده های ddRADseq............. . . . . . 59 6 نقشه برداری ارتباط با توان بالا در Brassica napus L.: روش ها و کاربردها...........67 7 ژنوتیپ پلی پلوئید SNP با استفاده از سیستم MassARRAY.... . . 93 8 qPCR ژنوتیپ گونه های پلی پلوئید......... . . . 115 9 مطالعات انجمن گسترده ژنوم (GWAS) ......... 123 10 رویکرد رونویسی برای توزیع جهانی SNP/Indel و ژنوتیپ گیاهی............. . . . 147 11 Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq).... . 165 12 اصلاح ژنوتیپ Competitive Allele-Specific PCR (KASP) برای تشخیص آلل های نادر.......... . . . . . 173 13 ژنوتیپ SNP مبتنی بر آمپلی فلور.........191 14 ژنوتیپ SNP با روش آمپلی فلور مانند...... . . . . 201 15 ژنوتیپ PCR معکوس نامتقارن نیمه حرارتی (STARP)... . . . . . . 221 16 ژنوتیپ اصلاح شده آلل اختصاصی qPCR (ASQ)...... . . 231 17 ژنوتیپ جهش خاص آلل با عدم تطابق در طراحی پرایمر..............249 18 PCR Allele Competitive Extension (PACE) ......... 263 19 کاوشگر فانوس مولکولی (MBP) مبتنی بر Real-Time PCR.... . . . . . 273 20 بیکن مولکولی – تقویت با واسطه حلقه (MB-LAMP)... . . . . 289 21 کاوشگر TaqMan برای شناسایی و تعیین کمیت گونه های گیاهی در قابلیت ردیابی غذا و خوراک.......... . . . . 301 22 سیستم جهش مقاوم در برابر تقویت تترا پرایمر (T-ARMS)... . . 315 23 سیستم جهش مقاوم در برابر تقویت پنتا پرایمر (PARMS) با انتخاب به کمک نشانگر SNP مبتنی بر PCR مستقیم (D-MAS).. . . . . 327 24 ژنوتیپ ذوب با وضوح بالا (HRM)...... . . . . . 337 25 سیستم های نشانگر ذوب با وضوح بالا (HRM) اصلاح شده افزایش تمایز بین آلل های هموزیگوت.... . . . 351 26 یک فناوری جدید ژنوتیپ SNP توسط Target SNP-Seq..... . . . 365 27 سنجش توالی شکافته تقویت شده چند شکلی مشتق شده (dPACS)... . . . 373 28 پلی مورفیسم مبتنی بر توبولین (TBP) در ژنوتیپ گیاهی.... . . . 387 29 ژنوتیپ ISSR چندگانه با توالی یابی (MIG-Seq).... . . . 403 30 کاربرد ژنوتیپ SolCAP در نقشه برداری انجمن سیب زمینی (Solanum tuberosum L.) ............ . . . . 415 31 هیبریداسیون فلورسانس درجا (FISH) برای ژنوتیپ کردن گونه ها و هیبریدهای قبیله Triticeae......... . . . . 437 32 پیشرفت نوآورانه در ژنوتیپ گیاهی......... . 451 فهرست مطالب................ . . . . . . 467
مشخصات فایل
عنوان (Title):	Plant Genotyping_ Methods and Protocols
نام فایل (File name):	1183-www.GeneProtocols.ir-Plant Genotyping_ Methods and Protocols-Humana Press (2023).pdf
عنوان فارسی (Title in Persian):	تعیین ژنوتیپ گیاهان - روشها و پروتکل ها
ایجاد کننده:	Yuri Shavrukov
زبان (Language):	انگلیسی English
سال انتشار:	2023
شابک ISBN:	ISBN 978-1-0716-3023-5 ISBN 978-1-0716-3024-2
نوع سند (Doc. type):	کتاب
فرمت (File extention):	PDF
حجم فایل (File size):	15.5 مگابایت
تعداد صفحات (Book length in pages):	464

پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود

درباره درگاه پرداخت نکست پی بیشتر بدانید