|
فهرست مطالب:
Preface . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . v
Contributors. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ix
PART I IN SILICO DESIGN AND OPTIMIZATION OF GUIDE RNA SEQUENCES
1 Cloud-Based Design of Short Guide RNA (sgRNA) Libraries for CRISPR Experiments. . . . . 3
2 Web-Based CRISPR Toolkits: Cas-OFFinder, Cas-Designer, and Cas-Analyzer . . . . . 23
PART II CHEMICALLY-MODIFIED GUIDE RNAS
3 Chemical Modification of Guide RNAs for Improved CRISPR Activity in CD34+ Human Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. . . . . . . . . 37
4 Gene Disruption Using Chemically Modified CRISPR-Cpf1 RNA . . . . . . . . . . . . 49
5 “Split-and-Click” sgRNA . . . . . . . . . . . . 61
6 Chimeric DNA–RNA Guide RNA Designs. . . . . . . . . . . . . 79
PART III EXPANDING THE CRISPR TOOLBOX
7 Harnessing tRNA for Processing Ability and Promoter Activity. . . . . . . . . . . . . . . 89
8 Targeting Noncoding RNA Domains to Genomic Loci with CRISPR-Display: Guidelines for Designing, Building, and Testing sgRNA–ncRNA Expression Constructs . . . . . . . 115
9 Controlling the Activity of CRISPR Transcriptional Regulators with Inducible sgRNAs . . . . 153
10 Gene Manipulation Using Fusion Guide RNAs for Cas9 and Cas12a. . . . . . . . . . 185
PART IV CHARACTERIZATION OF CRISPR EFFICACY AND SPECIFICITY
11 Methods for Measuring CRISPR/Cas9 DNA Cleavage in Cells . . . . . . . . . . . . . . 197
12 In Vitro Assays for Comparing the Specificity of First- and Next-Generation CRISPR/Cas9 Systems. . . . 215
13 Profiling Genome-Wide Specificity of CRISPR-Cas9 Using Digenome-Seq . . . . 233
14 Detection of CRISPR/Cas9-Generated Off-Target Effect by Integration-Defective Lentiviral Vector . . . . 243
15 Genome-Wide CRISPR Off-Target DNA Break Detection by the BLISS Method . . . 261
Index . . . . . . . . 283
مشخصات فایل
|
| عنوان (Title): |
CRISPR Guide RNA Design: Methods and Protocols |
| نام فایل (File name): |
727-www.GeneProtocols.ir-CRISPR Guide RNA Design_ Methods and Protocols-Springer US_Humana (2021).pdf |
| عنوان فارسی (Title in Persian): |
طراحی RNA با کریسپر- روشها و پروتکل ها |
| ایجاد کننده: |
Tudor A. Fulga, David J. H. F. Knapp, Quentin R. V. Ferry |
| زبان (Language): |
انگلیسی English |
| سال انتشار: |
2021 |
| شابک ISBN: |
9781071606865,9781071606872 |
| نوع سند (Doc. type): |
کتاب |
| فرمت (File extention): |
PDF |
| حجم فایل (File size): |
9.67 مگابایت |
| تعداد صفحات (Book length in pages): |
287 |
پس از پرداخت، دانلود فایل آغاز می شود
تمامی درگاه های پرداخت ژنـ پروتکل توسط شرکت دانش بنیان نکست پی پشتیبانی می شود. نکست پی دارای مجوز رسمی پرداختیاری به شماره 1971/ص/98 ، از شرکت شاپرک و بانک مرکزی جمهوری اسلامی ایران و دارای نماد اعتماد در حوزه (متمرکزکنندگان پرداخت) از مرکز توسعه تجارت الکترونیکی وزارت صنعت معدن و تجارت است.
